信息库布局采用分布式与集中式相结合的建设及运行服务模式，物理上分布在数据主中心和11个数据分中心。数据主中心建设内容包括综合信息库、数据主中心网络系统及运行环境、交换系统、安全系统和基础性工作等。分中心建设任务包括专题信息库、数据分中心网络系统及运行环境、交换系统、安全系统和基础性工作等。
数据主中心整合现有数据，通过交换系统汇集各数据分中心综合信息子库，建设综合信息汇集库；在综合信息汇集库的基础上整合来源于两个以上数据分中心的综合信息子库，建设综合信息库、综合信息产品库，根据电子政务的主流需求建设综合信息定制产品库；同时建设相应的元数据库和数据目录体系，并根据各数据库的不同特点建设相应的数据库管理系统。11个数据分中心根据自身业务特点和现有数据资源，按照本项目统一的时空框架数据基础、地理空间信息标准、分类编码体系、数据交换网络系统和信息管理的要求，建立各自的、互不重复的专题信息库和专题信息产品库，在此基础上建设各数据分中心的综合信息子库，同时建设相应的元数据库和数据目录体系，并根据数据库不同特点建设相应的数据库管理系统。
主中心数据库和各数据分中心的数据库通过网络系统将各数据库物理上连接为统一的整体，通过交换系统、安全系统实现各数据中心的数据库之间的信息共享、交换、数据访问与发布。通过标准规范体系和管理办法与制度来规范各数据中心的数据库建设。
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